Een toename in stikstofdepositie kan een negatief effect hebben op stikstofgevoelige habitattypen en leefgebieden. Op deze manier kunnen ontwikkelingen buiten een Natura 2000-gebied alsnog effecten hebben binnen het gebied. Sinds de uitspraak van de Raad van State in juli 2019 is de PAS onbruikbaar voor vergunningverlening ten aanzien van stikstof. De uitspraak van de Raad van State op 2 november 2022 heeft tot gevolg dat de Algemene Bouwvrijstelling niet mag meer worden gebruikt. Hierdoor moet voor alle projecten en plannen de stikstofeffecten uit zowel de gebruikfase als de aanlegfase beoordeeld worden. Momenteel is het volgende traject de manier waarop stikstof beoordeeld kan worden bij ruimtelijke plannen en projecten. Bij iedere stap wordt beoordeeld of er wel of geen vervolgstappen noodzakelijk zijn.